微机型万能工具显微镜是一种多用途的计量仪器，广泛应用于机械、电子制造业、计量测试等领域。它主要用于测量各种零件的尺寸、形状、角度和位置，如成型零件如样板、样板车刀、样板铣刀、冲模和凸轮的形状等。此外，微机型万能工具显微镜还可以用来测量外螺纹（如螺纹塞规、丝杆和蜗杆等）的中径、小径、螺距、牙型半角等。微机型万能工具显微镜的工作原理基于光学系统、直角坐标测量系统和被瞄准装置。
首先，被测工件的轮廓经过光学系统投影放大成像后，由瞄准装置瞄准被测轮廓的某一几何要素。标准量细分装置可以读出纵横两个方向的坐标值。接着，移动工作台及安装在其上的被测工件，瞄准被测轮廓的另一几何要素并读出其坐标值。这样，被测轮廓上这两个要素之间的距离即为工件长度。同时，被测轮廓上某两要素间的数值由瞄准装置和角度测量装置读出。
微机型万能工具显微镜常用的测量方法有直角坐标测量，这种方法就是将仪器主体垂直方向的两条线作为齿轴和驰轴，利用齿轴和驰轴建立坐标系，测量某个被测件上特殊点的位置。
